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超声波破碎法提取活性污泥DNA及其DGGE分析

论文类型 技术与工程 发表日期 2008-04-01
来源 哈尔滨工业大学学报
作者 万晶晶,张汝嘉,邢德峰,谢天卉,赵丽华,任南琪
关键词 超声波破碎法;活性污泥;DNA提取; PCR;变性梯度凝胶电泳(DGGE)
摘要 为快速提取活性污泥中的微生物DNA,进一步应用于变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术分析其群落结构,采用细胞超声波破碎法直接提取反应器活性污泥DNA,以16S rRNA V3区域通用引物进行PCR扩增,随后利用DGGE技术对扩增产物的多样性进行评估. 结果表明,超声波破碎法可以快速地提取活性污泥DNA,用超声波破碎法提取到的活性污泥克服了PCR扩增困难的问题. 在一定的超声波功率下,超声时间对DNA产率、PCR扩增效率和DGGE分析均有很大影响,实验的最佳超声时间为27 s. DGGE分析表明,用该法提取到的

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